熊鷹被列為一級的瀕臨絕種野生動物，也是華盛頓公約管制國際貿易的物種，除了受馴鷹人及標本商的青睞以外，鷹羽頭飾更是原住民的傳統文化；在面臨強大的獵捕壓力下，林務局委託屏科大進行熊鷹生態調查，希望藉此取得生態保育與傳統文化的平衡。

林務局委託屏科大野生動物保育研究所進行熊鷹生態調查，從民國九十八年開始，由孫元勳教授帶領調查小組，在屏東、台東山區進行研究，據孫元勳「較樂觀」的估計，目前全台熊鷹約有一千四百多隻，又以台東密度最高。

孫元勳表示，熊鷹亞成鳥在黑市每隻售價都在兩萬五千元以上，廿年前每年至少有十隻以上的仔鷹被獵捕販售。熊鷹羽毛也是排灣族和魯凱族的重要飾品，象徵崇高的身分和地位，在傳統中被視為靈鳥，配戴熊鷹羽的身分與數量都有嚴格限制，獵捕熊鷹更被視為禁忌。

但近來傳統式微，人人以擁有熊鷹羽頭飾為榮，在鷹羽黑市裡，最高貴的一對鷹羽可達三萬多元，過去十年內，在屏東、台東的捕獲數量，每年達廿到五十隻。

孫元勳指出，維持最小存活族群是保育稀有物種的首要工作，如何在兼顧熊鷹族群永續和傳統文化保存的精神下，取得互信和共識，讓熊鷹能世代翱翔在台灣森林裡，是必須持續努力的課題。

熊鷹，台灣最大型的居留性猛禽，堪稱是集神秘與尊榮於一身的天空霸主，屏東科技大學野生動物保育研究所在屏東、台東山區，調查熊鷹生態，揭露熊鷹「私生活」，讓人類對這種威風凜凜的森林老大，更添敬意。

這裡有熊鷹！屏科大野保所的助理研究員黃永坤、洪孝宇在突出峭壁的一株灰背櫟樹上，發現熊鷹巢位，兩人冒險爬上樹裝設自動相機，此時，母鷹已在上空盤旋警戒。

「轉頭時恰好看見縮翅對著我的臉俯衝而來的母鷹，很恐怖。」黃永坤說，當時熊鷹媽媽連續俯衝，一個巨型身影、一對銳利的鷹爪直撲而來。所幸，後方的洪孝宇不斷揮動樹枝掩護，否則即使沒有慘遭鷹爪，也會跌落深谷，性命難保。

洪孝宇表示，在山上觀察熊鷹，必須耐得住寂寞，抵抗台東的焚風，下大雨時，要面對不知該留守還是撤退的兩難，有時還會有不懷好意的虎頭蜂在偽帳旁虎視眈眈。

不過，「當看到熊鷹媽媽育雛的溫馨畫面，及熊鷹寶寶振翅學飛的那一刻，再怎麼苦也都煙消雲散」，黃永坤說，他大學時在南迴公路首次看到熊鷹，就深深著迷，這次能夠完整觀察牠們的生態，更是榮幸。

根據他們的觀察，熊鷹大約在十二月就開始築巢，隔年一月下蛋（只生一顆），孵蛋約需四十二天，育雛要八十天，整個繁殖季長達五個月。

洪孝宇表示，熊鷹育雛採男主外，女主內，也就是孵蛋、餵養幼鳥和巢位警戒，都由熊鷹媽媽負責，熊鷹爸爸則外出打獵，在巢外將獵物交接給老婆。

熊鷹的菜單，哺乳類以大赤鼯鼠及赤腹松鼠居多，另外還有台灣獼猴、長鬃山羊、山羌等的幼獸，甚至是食肉目的麝香貓、黃喉貂的幼獸，也都上了熊鷹的餐桌，而鳥類則有藍腹鷴、深山竹雞等等。

另外，他們還觀察到一個有趣的行為，熊鷹媽媽每隔兩三天就會帶回一節新鮮枝葉，這些綠巢材可不是給小鷹舖床用，而是因為沒吃完的獵物容易孳生寄生蟲，熊鷹媽媽挑選帶回的樹葉種類，有良好的除蟲效果，這就是大自然物種的奧妙。